Este pacote do R implementa ferramentas para analisar e simular dados genéticos. Originalmente desenvolvido para dados multialélicos, marcadores co-dominantes, como os microssatélites, adegenet agora também lida marcadores dominantes e permite qualquer ploidia nos dados. O implemento de mais memória e armazenagem de dados permite a análise de todo o genoma com SNPs.
É o programa mais completo para análise de dados populacionais no R.
adegenet armazena os dados genotipicos usando a classe S4 "genind":
Indivíduos nas linhas e alelos nas colunas em uma matriz chamada "tab", cada alelos é representado por 2 colunas.
Os elementos são acessados com o operados @ (e.g., x@tab). Informações adicionais são armazenadas em outros espaços (@ind.names, @pop, . . . )
Mais detalhes sobre a classe podem ser acessados pelo comando:
class?genind
