O programa Spatial Genetic Software (SGS), prevê ao usuário de Windows uma ferramenta amigável para analisar em pequenas e em grande escala, as estruturas genéticas e fenotípicas das populações.
O programa pode lidar com quase todos os tipos de dados genéticos, tais como marcadores co-dominantes (isoenzimas, microssatélites), marcadores dominantes (RAPDs, AFLPs) e marcadores citoplasmáticos. Os dados podem ser analisados como indivíduo de uma população (escala local) e como dados das frequências dos alelos ou haplótipos para as diferentes populações (larga escala).
O programa oferece várias estatísticas para analisar a estrutura genética espacial e fenotípica: índice de Moran, índice de Geary, número de alelos em comum e abordagens utilizando distâncias genéticas e valores de FST. A significância estatística de todas as medidas é verificada através da utilização de teste de permutação.
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